砂仁和草果的区别是产地不同、用处不同、生长环境不同。产地不同，砂仁分布在中国的福建、广东、广西和云南等地；而草果分布在中国的云南、广西、贵州等省区；用处不同，砂仁的果实供药用，在初夏的时候可赏花，盛夏的时候可观果；而草果是药食两用，既可以作调味香料，又可以以果实入药；
生长环境不同，砂仁喜欢热带南亚热带季雨林温暖湿润气候，不耐寒，喜漫射光，栽培砂仁需要寻找适当荫蔽的地方；而草果喜欢温暖湿润的气候，怕热，怕干旱，也怕霜冻，适宜生活在荫蔽度50%-60%左右的林下或者是溪边湿润并且排水良好的山谷坡地阴凉地带。
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