金燕耳和银耳的区别主要在于培育过程不同、口感不同、生长周期不同、营养价值不同等。培育过程不同：金燕耳是以十二种药食同源的中草药作为培养基培育而成，营养丰富且全面；而普通银耳则通常采用被农药和化肥污染过的麦麸、棉籽壳和椴木培植而成。
口感不同：金燕耳的口感较普通银耳更加嫩滑可口，且品相更加完好。生长周期不同：金燕耳的培育周期为六十天，每年培育两次，不施任何农药化肥，任其吸收培养基养分自然生长；银耳的培育周期通常在三十天至四十天，需要利用杀虫剂除虫，还需要利用尿素和化肥促进其生长，营养成分也会有所流失与破坏。
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