在职研究生和全日制学习的研究生毕业后，主要的差异在于：
证书上标注学习方式：参加同等学力申硕形式，可以获得与全日制一样的在职研究生学位，参加在职研究生双证专业学习，拿到毕业证书后，上面会标注学习方式，也就是会出现“非全日制”字样，而全日制研究生毕业证书上会标注“全日制”，但是两个证书的法律地位及效力是没有区别的，在使用方面也没有差异。
工作经验的丰富程度：在职攻读研究生，在汲取专业知识的同时，其工作经验也在不断积累，而全日制研究生由于脱产，即使在校参加了导师的相关实验项目，也仅仅是限于实验室经验，与职场摸爬滚打的实际经验还是差距很大的，这在以后工作的开展方面就会显现出来。
人际关系的广博性：在职研究生不仅拥有复杂丰富的职场关系圈，在进行研究生知识学习的时候，还能接触到更多志同道合的同学、导师，涉及不同行业领域，这种广博的人际关系是全日制研究生在学校生活中，无法接触到的。非在职研的研究生，也就是进行全日制研究生学习的人员，需要脱产学习，上课时间一般为周一至周五。
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